Summary
Samenvatting Cyclus 2.15 SOG - onderdeel E: cytogenetica
- Course
- Institution
Uitwerking cyclus 2.15 SOG - onderdeel E
[Show more]Preview 2 out of 8 pages
Preview 2 out of 8 pages
Add to cart
Getting your document ready...
Add to cart
Seller
Follow
Cussonia_Chrysiptera.parasema
Reviews received
Content preview
Cyclus 2.15 stoornissen in groei en ontwikkeling onderdeel E: cytogeneticaHS 6: Clinical cytogenetics: the chromosomal basis of human disease
Cytogenetica: studeren van chromosomen en hun abnormaliteiten.
o Chromosoom abnormaliteiten: veroorzaken vele genetische ziekten.
Intellectuele achterstand en wellicht abortus als gevolg.
o DNA polymorfismen bij ouders en nakomelingen onderzoeken
wordt duidelijk of veranderd chromosoom van vader of moeder komt.
1. heeft kennis van de cytogenetische techniek en nomenclatuur
Cytogenetic technology and nomenclature
o Gebruik van spindle punten colchicine en colcemid die ervoor
zorgen dat somatische cellen niet delen in de metafase. Chromosomen
zijn dan maximaal gecondenseerd en het beste te zien.
Hypotonische oplossing zorgt voor zwelling van cellen, breuk
van nucleus en betere separatie van individuele chromosomen
vervolgens gebruik van kleurende materialen die
geabsorbeerd worden door verschillende delen van
chromosomen productie van karakteristiek licht en donkere
banden die individuele chromosomen kan identificeren.
o Chromosomen analyseren in levend weefsel (vooral bloed) kweken 48-72 uur colcemid toevoegen
uiteindelijk bekijken van chromosomen op plaat.
Chromosomen worden gerangschikt op lengte en
geslachtschromosomen rechts onderin de hoek
karyogram/karyotype genoemd.
Verder rangschikken aan de hand van positie van
centromeer.
Centromeer dicht bij midden van chromosoom
metacentrisch.
Centromeer dichtbij de top acrocentrisch.
Centromeer tussen midden en top
submetacentrisch.
Top van elk chromosoom: telomeer.
Korte arm chromosoom: p
Lange arm chromosoom: q
Normaal vrouwelijk karyotype: 46, XX
Normaal mannelijk karyotype: 46, XY.
o Chromosome banding
Helpt bij zoeken van deleties, duplicaties en andere
structurele abnormaliteiten.
Grote banden op elk chromosoom zijn systemisch
genummerd.
Vb. 14q32 tweede band in 3e regio van lange arm
van chromosoom 14.
Verschillende typen
Quinacrine banding (Q-banding) fluorescentie
microscoop gebruiken.
Giemsa banding (G-banding) Giemsa kleuring nadat chromosomale eiwitten deels zijn
verteerd door trypsine.
Reverse banding (R-banding) warmte behandeling nodig en zorgt ervoor dat wit-zwart
batroon dat in G-banden en Q-banden zichtbaar is, terug komt.
o Handig bij kleuring van distale einden van chromosomen.
C-banding verkleurd constitutive heterochromatine ligt normaal gesproken dicht bij
centromeer.
Nucleolar organizing region stains (NOR stains) highlight de uitsteeksels van acrocentrische
chromosome.
Hoge resolutie banding verkleuring van chromosome tijdens profase of vroege metaphase
(prometafase) voordat ze maximaal condenseren.
o Profase en prometafase chromosomen zijn uitgebreider dan metafase chromosomen
meer banden meer detectie van duidelijke abnormaliteiten die niet met
conventioneel banding gezien worden.
2. heeft kennis van QF-PCR
3. heeft kennis van de toepassing van next generation sequencing om chromosomale afwijkingen aan te tonen
o Fluorescence in situ hybridization
, Gelabeld enkelstrengs DNA segment (probe) wordt blootgesteld aan gedenatureerde metafase, profase
of interfase chromosomen.
Probe ondergaat complementaire base paring (hybridisatie) met alleen de complementaire DNA volgorde
op een specifieke locatie van de gedenatureerde chromosomen.
Het deel dat gebonden is kan onder een fluorescentie microscoop worden bekeken.
FISH: kijken of een deel van een chromosoom is verwijderd in de patiënt.
Onaangetast persoon probe hybridiseert op twee plekken aanwezigheid van twee
homologe chromosomen in somatische celkern.
Probe hybridiseert op een van de chromosomen van patiënt patiënt heeft waarschijnlijk een
deletie van de kopie van het chromosoom op de plek waar geen hybridisatie plaatsvindt.
Werkt beter dan hoge resolutie banding en kan deleties zo klein als 1mb zien.
o Prader-Willi syndroom en Williams syndroom bv. diagnosticeren.
Extra kopieën van chromosoom regio detecteren.
o Probe hybridiseert in 3 of meer plekken i.p.v. 2.
o Combinaties van FISH probes gebruiken om chromosoom herschikkingen zoals
translocaties zichtbaar te maken.
FISH kan worden uitgevoerd bij chromosomen in de interfase metafase is niet nodig.
o Hierdoor sneller analyseren mogelijk.
o Vaak gebruiken bij analyse van foetale en parenterale chromosoom abnormaliteiten en
bij analyse van chromosoom herschikkingen in tumorcellen.
Uitvoering van FISH
o Gebruik van meerdere probes die allen met
een andere kleur zijn gelabeld zo kunnen
de meeste abnormaliteiten in chromosomen
13, 18, 21, X en Y worden getest.
Spectral karyotyping gebruik maken van
combinaties van 5 verschillende fluorescente probes in
verbinding met speciale camera’s en beeld
processende software zodat elk chromosoom uniek
gekleurd wordt hele chromosoom wordt over de
lengte gekleurd.
o Wordt minder gebruikt.
o Comparative genomic hybridization
Verlies of duplicatie van gehele chromosomen.
DNA is weg gehaald van een testbron zoals cellen van een tumor of bloedcellen van een patiënt.
DNA wordt gelabeld met substantie die een kleur (vb. rood) vertoont onder een fluorescentie
microscoop.
DNA van normale controle cellen wordt gelabeld met een tweede kleur (groen).
DNA van beide sets wordt gehybridiseert tot normale metafase chromosomen op een plaat.
o Bij duplicatie in een tumorcel zal de corresponderende regio van het metafase
chromosoom hybridiseren met overvloedige hoeveelheden van rood gelabeld DNA.
Wordt rood zichtbaar onder microscoop.
o Bij verwijderde regio in tumor cellen zal corresponderende regio van metafase
chromosoom allene hybridiseren met groen gelabeld controle DNA en de regio wordt
groen onder de microscoop.
Handig bij scannen van deleties en duplciaties van chromosoom materiaal in kanker cellen waar detectie
van zulke alteraties kan helpen bij voorspelelnv an type en ernst van kanker.
Beperking: deleties of duplicaties van metafase chromosomen
kleiner dan 5-10 Mb kunnen microscopisch niet worden
gedetecteerd.
Hogere detectie door array CGH (aCGH) waarbij test en
controle DNA wordt gehybridiseerd met microstraling
met duizenden oligonucleotide probes wiens DNA
volgorden corresponderen met specifieke regio’s van
het genoom.
o Deleties en duplicaties op een enkel gen
kunnen zelfs ontdekt worden.
o Kost weinig tijd.
o Geen celdeling nodig (wel bij analyse van
metafase chromosomen).
o Kan alleen geen gebalanceerde
herschikkingen van
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller Cussonia_Chrysiptera.parasema. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $11.70. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
13 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now
Recently viewed by you
